潜伏梅毒的发生主要取决于机体本身的免疫力、治疗与梅毒螺旋体之间的较量的结果。当机体免疫功能正常，或在治疗其他疾病时曾不正规地使用过与治疗梅毒有关的药物，产生了一定的治疗效果时，体内的梅毒螺旋体受到一定的限制。
当机体在某阶段健康状况不佳、免疫功能降低时，梅毒螺旋体可乘机在人体内广泛活动并损害各种组织。当出现前一种情况时，即为潜伏梅毒，当出现后一种情况时，就叫做显发梅毒。
潜伏梅毒的分期完全同显性梅毒，后天梅毒以2年为界，先天梅毒以2岁为界，均可分为早期和晚期。
潜伏梅毒，由于患者基本上没有感觉和表现，即使有也是很轻微的极易被病人本人所忽视而未引起重视，不及时去就诊。而体内组织内螺旋体依然存在，对组织器官的破坏依然在进行；潜伏梅毒病人依然有传染性，对周围性侣或密切生活在一起的亲人构成威胁。可见，要早期发现潜伏梅毒病人，在各种人群中开展梅毒血清筛查试验是十分重要的。
潜伏梅毒是指已被确诊为梅毒患者，在某一时期，皮肤、粘膜以及任何器官系统和脑脊液检查均无异常发现，物理检查，胸部X线均缺乏梅毒临床表现，脑脊液检查正常，而仅梅毒血清反应阳性者，或有明确的梅毒感染史，从未发生任何临床表现者。称潜伏梅毒。
潜伏梅毒的诊断还要根据曾患一期，二期梅毒的病史，与梅毒的接触史及分娩过先天性梅毒的婴儿史而定。以前的梅毒血清试验阴性结果和疾病史或接触史有助于确定潜伏梅毒的持续时间。
感染时间2年以内为早期潜伏梅毒，2年以上为晚期潜伏梅毒，另一类则为病期不明确的潜伏梅毒。潜伏梅毒不出现症状是因为机体自身免疫力强，或因治疗而使螺旋体暂时被抑制，在潜伏梅毒期间，梅毒螺旋体仍间歇地出现在血液中，潜伏梅毒的孕妇可感染子宫内的胎儿。亦可因献血感染给受血者。
